Het Zijper Museum heeft elk jaar een thema expositie. Elke expositie bevat altijd enkele educatieve elementen. Zo is er een DVD-film waarin de kinderen kennis maken met de plaatselijke geschiedenis van Zijpe en Petten. De leerlingen worden in het museum begeleid door een oud onderwijzer. Voor een groepsbezoek dient van tevoren een afspraak gemaakt te worden.